申报国家级高新技术企业认定需要准备的材料主要包括以下几个方面：

1、高新技术企业认定申请书：通过高新技术企业认定管理系统在线填写，从系统中打印出封面，由企业法人签名、加盖企业公章后扫描上传至系统。

2、企业依法成立证明材料：选择适用告知承诺制的企业提供《证明事项告知承诺书》;不适用告知承诺制的企业提供《营业执照》等相关材料。

3、知识产权相关资料：选择适用告知承诺制的企业提供《证明事项告知承诺书》;不适用告知承诺制的企业提供知识产权相关材料，包括知识产权证书及反映技术水平的证明材料等。

4、科研项目立项证明：省级(含计划单列市)以上科研项目立项证明，对已验收或结题项目需附验收或结题报告。

5、科技成果转化：总体情况与转化形式、应用成效的逐项说明。

6、研究开发组织管理：总体情况与五项指标符合情况的具体说明。

7、企业高新技术产品(服务)的关键技术和技术指标的具体说明：相关的生产批文、认证认可和资质证书、产品质量检验报告等材料。

8、企业职工总体情况说明与科技人员名单。

9、经具有资质并符合条件的中介机构出具的企业近三个会计年度研究开发费用、近一个会计年度高新技术产品(服务)收入专项审计或鉴证报告：并附研究开发活动说明材料。

10、经具有资质的中介机构鉴证的企业近三个会计年度的财务会计报告：包括会计报表、会计报表附注和财务情况说明书。

11、近三个会计年度企业所得税年度纳税申报表。

12、其他相关证明材料：如企业变更名称或与认定条件有关的重大变化(如分立、合并、重组以及经营业务发生变化等)的证明文件等。

需要注意的是，上述材料的具体要求可能会根据当地科技部门或高新技术企业认定管理机构的具体规定有所不同。因此，在准备材料时，企业应仔细阅读并遵循当地的具体指南和要求。此外，由于高新技术企业认定的标准和流程可能会有所变化，建议企业在申报前咨询当地的科技部门或专业服务机构，以获取最新的信息和指导。