1.地方科技局/科委

这是补助申请的核心部门。企业需根据注册地归属，向区/县或市级科技局提交材料。例如：

江苏：各市科技局发布申报通知(如南京、苏州)，部分区县(如江宁区、苏州工业园区)另有叠加奖励。

武汉硚口区：直接向区经信和科技创新局提交材料。

上海静安区：通过“上海科技”平台在线填报，区科委审核。

2.线上政务平台

多数地区要求线上系统填报(如江苏使用“省高新技术企业培育库系统”，上海使用“上海科技”平台)，同时需提交纸质材料。

3.财政局或联合窗口

部分市县由科技局与财政局联合审核，资金最终由财政局拨付(如抚顺市流程)。