根据《高新技术企业认定管理办法》规定，跨认定机构管理区域迁移的高新技术企业，分为以下两种情况：

1.整体迁移：在其高新技术企业资格有效期内完成整体迁移的，其资格继续有效，不需要重新认定。例如，某高新技术企业从一个省整体迁移到另一个省，只要在资格有效期内完成迁移，就可继续保持高新技术企业资格，企业认定证书编号和有效期不变。企业需要登录 “高新技术企业认定管理工作网” 或 “火炬中心统一身份认证与单点登录平台”，按要求填写相关信息并提交迁移申请及相关证明材料。

2.部分搬迁：跨认定机构管理区域部分搬迁的，由迁入地认定机构按照认定办法重新认定。比如，企业只是将部分生产或研发部门等搬迁到其他认定机构管理区域，这种情况下，迁入地认定机构会根据相关认定办法，对企业进行重新认定，以确定其是否仍符合高新技术企业的条件。