根据高新技术企业年报填报相关规定及操作流程，若企业已保存年报数据并提交，但需修改，可按以下步骤操作：

1.联系当地认定机构

企业需主动联系负责年报审核的当地认定机构（如地方科技局、高新区管委会等），说明需修改已提交年报的原因，并请求认定机构进行“退回+发送处理”操作。

2.等待认定机构处理

认定机构收到企业请求后，会在系统中将已提交的年报数据退回至企业可编辑状态，并通知企业可重新填报。

3.重新填报并提交

企业登录科技部政务服务平台（https://fuwu.most.gov.cn/），进入“火炬中心业务办理平台”中的“科技部火炬统计调查”模块，查看退回的年报数据，根据需要进行修改，完成数据校验后再次提交。

注意事项：

修改操作需在年报填报截止日期前完成，逾期可能无法修改。

若认定机构因特殊原因无法退回数据，企业需按照认定机构的要求提供书面说明或补充材料，配合完成修改流程。

修改后的年报需确保数据真实、准确，符合高新技术企业年报填报要求，避免因数据问题导致审核不通过。