专精特新“小巨人”企业奖补资金的使用有明确的规定和方向，具体如下：

1.企业自主使用（95%以上）

奖补资金总额的95%以上由企业围绕“三新一强”目标任务自主安排使用，主要用于以下方面：

打造新动能：加强企业创新能力建设，包括人才培养、组织机构优化、设备条件升级等，打造创新团队。

攻坚新技术：突破关键核心技术，开展原创性、颠覆性科技创新研究，产生科技创新成果。

开发新产品：以科技创新引领产业创新，加快科技成果向现实生产力转化，开发具有市场竞争力的新产品。

强化产业链配套能力：围绕重点领域龙头企业产业链供应链需求，加大产业化投入，提升产业链供应链韧性和安全水平。

2.地方培育赋能（不超过5%）

不超过奖补资金总额的5%可由地方政府用于对“小巨人”企业培育赋能，具体包括：

提供管理诊断、人才培训、质量诊断等服务。

建立健全以技术支持、成果转化、资金对接、企业孵化、产业融通等为主要功能的专精特新赋能体系。

需注意，奖补资金不得用于工资、水电费、房租费、物业费、餐饮费等日常运转支出，也不得用于房屋、基金、股票、期货等投资性经营支出，以及业务接待和其他法律法规禁止的项目。