‌创新型中小企业的认定管理主要由工业和信息化部负责‌。工业和信息化部印发了《优质中小企业梯度培育管理暂行办法》，该办法对评价认定工作进行了规范，并对培育管理提出了系统性要求‌。

具体到各个省份，认定管理工作由各省的工业和信息化厅负责。