科技成果转化项目的认定流程一般包括：1.由项目承担单位提交申请材料，包括科技成果证明、转化实施方案、经济效益预测报告等；2.由相关科技行政管理部门或指定的专业机构对申报材料进行形式审查；3.通过形式审查后，组织专家进行实地考察和技术评审；4.根据评审结果，由科技行政管理部门作出是否予以认定的决定并公示；5.公示期满无异议的，正式颁发科技成果转化项目认定证书。