申请北京市新技术新产品（服务）证书不收取任何费用。该认定工作由北京市科学技术委员会、中关村科技园区管理委员会等多部门联合开展，旨在鼓励创新主体申报，推动科技创新和产业发展，整个认定过程不涉及官方收费项目。

需注意，部分中介机构或代理机构可能会提供有偿的申报辅导、材料准备等服务，但这些费用并非认定工作的强制要求，企业可根据自身需求选择是否委托。