深圳市工程技术研究中心的认定周期一般为3年。

根据《深圳市工程技术研究中心认定与运行管理办法》，市科技行政主管部门制定考核评估指标，对已认定的市工程技术中心的运行情况和建设绩效进行定期评估，3年为一个考核评估周期，重点评价其研发创新成果、研发条件保障与队伍建设、运行管理、经济技术效益等情况。评估结果分为优秀、良好、合格、不合格四个等级。